Depende de la secuencia.
Homólogo al pliegue de una proteína conocida- Muy bueno
No es homólogo a ningún pliegue conocido de proteínas: lamentablemente malo al obtener <2 rmsd
Si quiere saber más, un buen lugar para ir es la competencia de plegado de proteínas CASP, donde los pliegues de novo son predichos por varios grupos en una competencia organizada cada dos años.