Los GPCR tienen estructuras muy bien definidas, con longitudes transmembrana (TM) muy consistentes.
Observando, por ejemplo, TM2, el número habitual de aminoácidos presentes es 28. Suponiendo un paso regular de 0,15 nm por residuo, esto da una longitud de TM de 4,2 nm (si comprueba, por ejemplo, PDB 1GZM, puede ver que esta longitud es correcta).
Gráfico de serpiente de β2AR que muestra el tamaño de TM2; adaptado de Acta Pharmacologica Sinica (Romper hielo en biología estructural GPCR).
Al igual que con todas las proteínas transmembrana, la longitud de la MT coincidirá con el grosor de la bicapa lipídica donde se encuentra. Las bicapas lipídicas suelen tener un grosor de ~ 3-3,5 nm, por lo que los GPCR generalmente se encuentran en regiones más gruesas de la membrana, mejoradas con lípidos más largos, como colesterol y esfingolípidos.
