Como la intención de su pregunta es comprender la eliminación de la molécula de agua cuando se forma el enlace peptídico, y el MW exacto no es necesario en su caso, podemos tomar el peso molecular promedio de un aminoácido como 110D y considero que su péptido como lineal sin ningún aminoácido especial o no natural.
Recuerde: 1 molécula de agua (H2O) se liberará cuando se forme un enlace peptídico. (R-COOH + NH2-R ==> R-CONH-R + H2O)
es decir, el ~ MW de un péptido con 10AA será 10 × 110- (9 × 18) = 938D
Esto puede diferir mucho depende del MW exacto del AA en su secuencia.
Pero espero que esto sirva a tu propósito.
