El enlace amida proporciona a la cadena principal de dicho polímero cierta rigidez debido al carácter de doble enlace parcial de los enlaces CN. Por lo tanto, la cadena principal de aminoácidos alfa alterna enlaces CC que son muy libres de rotar con estos otros enlaces que no lo son, manteniendo los tallos de los grupos laterales en ciertas direcciones favorables.
Uno podría obtener algo del mismo personaje (aunque no tanto de esa rigidez) con una columna vertebral de poliéster, por ejemplo, de unidades de beta-hidroxipropionato alfa-sustituido. Sin embargo, los enlaces éster serían algo más propensos a la hidrólisis no enzimática que los enlaces amida.
El hidrógeno en el nitrógeno de la amida también hace posible el enlace de hidrógeno con el oxígeno de otro enlace peptídico, que no estaría disponible en un poliéster.