Un contribuyente clave para los costos actuales de síntesis de oligonucleótidos es que la química de la fosforoamidita es exquisitamente sensible al agua; los solventes usados (como el acetonitrilo) deben estar completamente secos y, por lo tanto, son de los grados más altos.
Varias compañías y grupos académicos están trabajando en la síntesis dirigida de ADN usando enzimas. Si esto tiene éxito, el costo de la síntesis podría reducirse drásticamente, tal vez pareciéndose más a costos de secuenciación.
