¿Por qué los azúcares casi siempre están en la configuración D en la naturaleza?

Evolución. La estabilidad de la conformación D y L de un azúcar en aislamiento es idéntica, * lo mismo que cualquier par de moléculas de imagen especular. Sin embargo, esto solo aplica
si no está interactuando con otra molécula asimétrica. Para una primera aproximación razonablemente buena, los sitios de unión de las enzimas se ajustan a las moléculas que actúan como una mano en un guante. El corolario necesario de esto es que las enzimas solo pueden funcionar bien para una imagen especular. La otra forma sería como poner el guante equivocado en la mano.
Ver también ¿Por qué los aminoácidos en la naturaleza se encuentran solo en la configuración L?

* Idéntico al menos a cualquier medida que podamos hacer actualmente. Los cálculos teóricos que implican la interacción Débil predicen que existe una diferencia extremadamente pequeña entre las formas D y L (pico a femtomola por joule o alrededor de 1 billonésima de la diferencia entre la silla y la conformación del barco) (1)
1) ¿Cuán importante es la violación de la paridad para la quiralidad molecular y biomolecular?

No tengo una respuesta para el “por qué”, pero estoy interesado en esta pregunta porque hace años cuando estaba trabajando en un laboratorio de alimentos, una cosa que hice fue probar la sacarosa. El instrumento que estaba usando era bastante confiable y los resultados fueron bastante estables con el tiempo, pero no siempre. Había un tipo de muestra que solía obtener mezclada con canela (no tengo idea si eso es un detalle significativo: siempre fue el caso con estos resultados extraños) en la que los niveles de D-sacarosa y dextrosa variaron rápidamente después mezclando con agua Me dejó perplejo un poco y luego descubrimos que el instrumento no reconocía L-sacarosa y que la L-sacarosa era bastante inestable. Nunca tuve la oportunidad (o la razón) de seguir adelante con esto, pero es probable que otra persona sí lo haya hecho.