Hablando en términos generales, lo primero que debe hacer es comprender la química, la biología y la física de por qué funciona su protocolo. Si no lo entiendes, no puedes jugar con eso.
A partir de ahí, debe obtener algunas ideas de lo que se puede modificar. Afortunadamente, cuando intentabas descubrir cómo funciona un protocolo, viste algunas variaciones de él. Esto puede ser como alterar el tiempo de un análisis, la cantidad de células que usa o las concentraciones de un químico. Cuando empiece a tratar de optimizar, debe configurar el protocolo donde lo hace utilizando su método anterior, o al menos hágalo de tal forma que pueda comparar directamente los dos.
Recuerde incluir controles positivos y negativos. Si está viendo un resultado con su control positivo, nada con su control negativo, y nada con su grupo experimental, no es que el ensayo no funcionó, es que no hay nada allí. No quiere descuidar los buenos controles y generar un falso positivo debido a la sobre-optimización.