Hay varias diferencias químicas y biológicas entre la glucosa alfa y beta.
La diferencia química ocurre en la forma en que los átomos de oxígeno, carbono e hidrógeno se unen, con la molécula de betaglucosa siendo más estable. Biológicamente, la glucosa alfa constituye el almidón mientras que las moléculas beta glucosa son las que componen la sustancia más dura y resistente conocida como celulosa .
Y también hay una diferencia estructural: en la glucosa alfa, el grupo hidroxilo (OH) se une hacia abajo y lejos de la estructura principal. En la glucosa beta, el grupo hidroxilo se une por encima del anillo y en el primer carbono.