¿Cómo se determina una subunidad de una proteína?

Una subunidad de una proteína es una sola molécula (polipéptido, cadena de aminoácidos) que cumple una función, ya sea solo o en conjunto con otras moléculas. Algunas proteínas constan de una única subunidad (monómeros), otras de unas pocas subunidades (oligómeros), y otras consisten en muchas subunidades (multímeros).

Cada subunidad de una proteína está codificada por uno o más genes, que luego se transcriben y traducen. El producto de su traducción es la subunidad que está buscando. Si no conoce la secuencia genética que codifica la proteína, puede hacer la secuenciación de proteínas mediante técnicas experimentales como la espectrometría de masas.

Algunas cosas que una subunidad proteica no es :

• una sola o colección de estructuras secundarias, como alfa-hélices y cadenas beta
• un dominio evolutivo / funcional
• un motivo de aminoácidos conservado

Por supuesto, si ves una estructura proteica que determina su descomposición en subunidades es trivial. Miras las entidades desconectadas en tu estructura.

Las proteínas tienen algunas subunidades diferentes, pero las más grandes son las hélices alhpa y las láminas Beta.

La mejor manera de decir que están “determinados” es que la secuencia polipeptídica favorece dichas estructuras a través de interacciones débiles entre moléculas de cadena lateral. Estas estructuras representan un estado de reposo de baja energía para la molécula en su estado plegado.

Podría decirse que son “descubiertos” por los biólogos computacionales que predicen las conformaciones de protien o por la revisión de muchos cristalogramas de rayos X detallados.

Espero que esto ayude, si tienes una pregunta más detallada, me complace brindarte una respuesta más detallada.