Hay muchas partes de una proteína, la parte donde se une al objetivo, el sitio catalítico, el sitio alostérico, el sitio inhibidor, etc. Estas partes se pueden dividir en partes llamadas dominios donde varias estructuras plegadas de cadenas peptídicas forman una función unidad de la proteína. Cada dominio de proteína consiste en cadenas α helicoidales, hojas plisadas β conectadas a través de motivos. Algo como esto-
Donde las flechas significan hojas plisadas.