Sí.
Probablemente la mejor respuesta que he visto aquí es la epigenética, pero vale la pena elaborar un poco para ser claro.
Simplemente tener un determinado gen o alelo no es tan determinista como una vez (muy recientemente) se pensaba que era. Los sistemas biológicos son muy buenos para adaptarse al entorno en el que se encuentran. Esto se lleva a cabo modificando la expresión génica (un subconjunto de los cuales son proteínas) en función del medio ambiente. La expresión de genes variables basados en las condiciones ambientales se puede ejecutar de dos maneras diferentes.
1. Los genes que codifican las proteínas interactúan con el medio ambiente. Por ejemplo, se sabe que ciertos alimentos inhiben la inflamación a través de la vía NFkB (por ejemplo, capsaicina, curcumina, resveratrol …). Este es un mecanismo directo por el cual el entorno puede influir en la expresión de proteínas a través de factores de transcripción.
2. La epigenética, como ya se mencionó, es un método más indirecto que también puede influir en la expresión génica. Estos son los llamados “cambios suaves”, lo que significa que se pueden deshacer, a diferencia de las mutaciones genéticas. Se ha demostrado que la abundancia de alimentos, por ejemplo, afecta la expresión génica. (Cabe señalar que este concepto de modificación de expresión génica es distinto del concepto lamarckiano de que estos cambios son hereditarios, lo cual es muy controvertido y no estoy comentando aquí).
Puede haber otros mecanismos de control que yo desconozco (por ejemplo, la cantidad de energía disponible para el sistema a través de la fosforilación oxidativa mitocondrial es una forma de limitar un proceso si los recursos se agotan). De hecho, si tuviera que adivinar, probablemente haya varias otras formas. Como mencioné, los sistemas biológicos son excelentes para adaptarse al medio ambiente. Si algo es importante para el organismo, probablemente haya muchas maneras de detectarlo y reaccionar ante él.
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Entonces, a menos que las células genéticamente idénticas experimenten exactamente las mismas condiciones, probablemente sinteticen proteínas diferentes. De hecho, dependiendo del nivel de precisión requerido para un experimento, esto puede tener serias implicaciones para los laboratorios que intentan replicar estudios en diferentes partes del mundo. Los hallazgos de escalas gruesas aún pueden mantenerse bajo una variedad de condiciones, pero un experimento de proteoma, por ejemplo, podría obtener resultados diferentes de nada más que las diferencias muy sutiles en la cantidad de tiempo que las células estuvieron expuestas al clima local fuera de un incubadora (de hecho, eso suena como si fuera un experimento genial). ¡Cuánto depende ese efecto depende de lo que le interesa!