La timidina es una base de ADN, la 5-metiluridina es una base de ARN. La diferencia en la estabilidad se debe a la presencia del grupo OH adicional en el azúcar (abajo a la derecha); Los grupos OH son propensos a la hidrólisis (ácido + R-OH = H2O + R, etc.).
Aquí tengo una respuesta más detallada: la respuesta de Robin Corey a ¿Qué tipo de azúcar contienen el ARN y el ADN?
PD: Sé que esa no es una reacción química adecuada en mi respuesta. ¡Es pseudoquímica!