Eso sin duda dependerá de qué tan lejos de las condiciones fisiológicas normales que está preguntando. Cuanto más lejos de las condiciones “normales”, menos plegado esperaría de cualquier conformación de proteína. El plegamiento de proteínas es un proceso tanto termodinámico como cinético; la estructura primaria “quiere” enrollarse o plegarse de manera que se encuentre en su conformación de energía más baja en un ambiente dado, pero ciertas secuencias de AA se plegarán más rápidamente que otras, la velocidad de plegamiento también determina parcialmente su conformación final.
Por encima de cierta temperatura o fuerza iónica uno esperaría que la mayoría de las proteínas se desnaturalizaran completamente hasta sus estructuras primarias (secuencia AA simple). Obviamente, un pH bajo o alto también puede inducir desnaturalización.
¿El plegamiento de proteínas todavía ocurre fuera de las condiciones fisiológicas?
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¿Cuáles son algunos ejemplos de drogas que se dirigen a las proteínas de membrana?
Supongo que la siguiente pregunta es, ¿dónde debería empezar a buscar en la literatura para encontrar el plegamiento de proteínas fuera de las condiciones fisiológicas? Hay una gran cantidad de variables que se pueden encontrar.
Estoy pensando más en términos de estructura secundaria, la hélice alfa y las conformaciones de la hoja beta para comenzar. Sería fascinante ver cómo las secuencias primarias reaccionan en diferentes condiciones sin chaperones para estabilizar la estructura. Supongo que podría haber algunas simulaciones por computadora que podrían comenzar a predecir bajo condiciones específicas.
Alguien debe haber comenzado esta investigación ya.
En ciertos casos, sí, otras veces, no. Por ejemplo, me imagino que las interacciones más débiles en la estructura de la proteína (como los enlaces de hidrógeno) serán más susceptibles a ser interrumpidas, pero las cosas más fuertes como los enlaces disulfuro serían menos propensas a ser interrumpidas. Dicho esto, todas las proteínas tienen condiciones en las que se desnaturalizarán, por lo que depende de qué proteína, qué variable está cambiando y cuán extremas son las condiciones. Me imagino que si las condiciones extremas no afectaran el plegamiento de proteínas, las chaperoninas no serían necesarias.
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