Está determinado por múltiples factores:
- la secuencia de aminoácidos dentro de la estructura primaria de la proteína de la cadena polipeptídica – el plegamiento de la proteína se produce debido a las interacciones entre los residuos de aminoácidos. Estos residuos de aminoácidos reaccionan de varias maneras dependiendo de su estructura. Por ejemplo, los residuos polares cargados pueden formar enlaces iónicos, mientras que los residuos de cisteína pueden formar enlaces covalentes llamados enlaces disulfuro. Los efectos estéricos también entran en juego (por ejemplo, debido a su geometría, rupturas de prolina o torceduras alfa de hélices)
- temperatura y pH : como probablemente sepa, estos factores pueden causar la desnaturalización de la proteína. Las preguntas sobre cómo estos dos factores causan desnaturalización ya han sido respondidas aquí en Quora. Y al leer las respuestas, puede comprender el efecto general de estos dos factores sobre el plegamiento y la estructura de las proteínas. ¿Cómo se desnaturalizan las proteínas a valores extremos de pH? ¿Por qué las altas temperaturas desnaturalizan las proteínas?
- hidrofobicidad del medio ambiente: el efecto hidrofóbico es importante para el plegamiento de proteínas, ya que la mayoría de las proteínas contienen un núcleo hidrofóbico cuando se encuentran en su estado nativo.
- presencia de chaperona molecular – proteínas que ayudan a que otras proteínas se doblen correctamente. Lo hacen por diversos mecanismos, por lo general, proporcionando el microambiente adecuado para el plegamiento de proteínas.
