Tris-HCl es solo una base Tris con un equivalente de HCl presente para cada molécula de Tris. Por lo tanto, es esencialmente una versión de Tris que ha ajustado su pH hacia abajo incluso antes de llegar a la solución.
Puede alterar por completo las propiedades de su gel usando Tris-HCl versus Tris base, especialmente si no está ajustando el pH de Tris-HCl de manera apropiada. No se supone que Tris-HCl tenga su pH ajustado en solución con una base fuerte. En cambio, está diseñado para ser amortiguado por la base Tris, y se supone que debes calcular la masa de Tris y Tris-HCl secos para que se disuelva y te proporcione un tampón con la concentración deseada de Tris y pH. El ajuste del pH de Tris-HCl con una base fuerte (como hidróxido de sodio, NaOH) no aumenta la capacidad de amortiguación de la solución. En su lugar, neutraliza el HCl que está presente para producir agua y sal y normalmente dará como resultado una cantidad significativa de NaCl adicional en relación con un tampón al mismo pH y la misma concentración de Tris que se realizó ajustando el pH de la base Tris con HCl. Esa sal adicional dará como resultado una resolución más baja (tus bandas se volverán borrosas si aparecen) porque protege tu proteína de la corriente que pasa a través del gel.
Para resumir, no use Tris-HCl a menos que sepa lo que está haciendo.
