¿Pueden los fragmentos del gen gBlocks incorporarse en los genomas bacterianos si contienen regiones homólogas flanqueantes? ¿Cuánto tiempo tienen que ser las regiones para obtener una buena frecuencia de recombinación?

Los gBlocks son simplemente genes sintéticos no clónicos: son una población de fragmentos que tienen un consenso de diseño y muchos fragmentos pueden ser perfectos, pero dentro de la mezcla hay errores.

Para la recombinación, depende en gran medida del contexto. La recombinación asistida roja Lambda aka recombinación se usa comúnmente. Creo que los flancos de tan solo 50 pares de bases pueden funcionar de manera confiable, pero eso vale la pena verificarlo. El uso de Cas9 para cortar o mellar la región objetivo también puede estimular la recombinación.

Estudiar la expresión génica y la función

Revisa mientras reflexiono sobre esta pregunta.

Sí.

Yo diría que de 20 a 25 bases variables para promover un nivel aceptable de recombinación.