¿Qué causa exactamente que los antibióticos sean menos eficientes año tras año?

Es un gran ejemplo de evolución, selección natural, supervivencia del más apto.

Cuando usas un antibiótico para eliminar el 99,9% de las bacterias, el 0,1% que sobrevivió será el más duro del grupo y acabas de matar a la competencia. Las bacterias se reproducen asexualmente a través de la fisión binaria, lo que significa que sus “descendientes” serán clones de la primera bacteria, con las mismas cualidades que la hicieron sobrevivir a la primera cura de antibióticos. Las bacterias que de otro modo serían clones perfectos entre sí pueden obtener nuevo material genético a través de la mutación y la conjugación bacteriana, lo que a su vez puede producirles nuevas habilidades como la resistencia a los antibióticos. Una nueva ronda de antibióticos y se destacarán nuevamente frente a sus competidores y la próxima generación de bacterias tendrá esa nueva habilidad.

Entonces, cada vez que se prescriben antibióticos, se otorga una ventaja competitiva a la bacteria más resistente a ellos. Repita el proceso suficientes veces y tendrá bacterias como MRSA, ESBL y VRE.