Veamos:
Es imposible que los padres tengan el mismo genotipo si, por ninguna otra razón, los padres deben ser de diferentes sexos. Ya sabes lo de XY vs. XX. El cromosoma X y el Y contienen diferentes genes
Habiendo dicho eso, las posibilidades de pensamiento de dos personas que tienen el mismo genotipo pero para los cromosomas sexuales son tan pequeñas que se consideran imposibles. Por supuesto, la mutación puede ocurrir, pero mi suposición es que eso no es lo que el escritor está hablando. Lo mismo ocurre con la disomía uniparental. Ambos son relativamente raros.
El gran problema sería la enfermedad relacionada con la herencia autosómica recesiva. Se ha calculado que, en promedio, cada ser humano camina con seis alelos que codificarían una enfermedad letal si se combinan con el mismo alelo. Dos personas con genotipos idénticos proporcionarían la situación perfecta para que eso suceda. y de hecho estas enfermedades letales serían un resultado muy común.
En general, la primavera tendría genotipos muy similares a los de los padres, pero la supervivencia sería poco probable (alrededor del 18%). No quiero que esta respuesta sea demasiado complicada, pero revisaré las matemáticas si me preguntas.
Editar: en el ejemplo exacto que usted dio, las posibilidades de que ambos alelos experimenten la misma mutación se encuentran bajo el título de ser posible, pero tan raras como para decir que nunca sucederán.