Una forma es utilizar un anticuerpo para reducir el factor de transcripción y luego secuenciar el ADN adjunto. A continuación, puede alinear las secuencias para hacer referencia a los genomas para obtener una lista de genes a los que se sabe que se une el factor de transcripción. Este experimento se llama ChIP-seq, abreviatura de “Inmunoprecipitación de cromatina – secuenciación”. Para una introducción un poco más detallada, pero aún accesible, vea Introducción a ChIP-seq
Cómo encontrar la lista de genes en los que actúa cada factor de transcripción
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Los factores de transcripción actúan sobre cada cadena de ADN o ARN (en lo que esté trabajando) pero generalmente se unen a la cadena que comienza con un nucleótido AUG. El AUG también se conoce como el codón de inicio. Tiene que haber un entorno favorable con ciertas enzimas para que los factores de transcripción se unan y comiencen la replicación.
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