Los plásmidos que codifican Cas9 generalmente contienen una secuencia de ADN adicional que codifica una señal de localización nuclear (NLS). Este NLS puede ser reconocido por ciertas proteínas llamadas importinas, que facilitan la importación de proteínas que contienen NLS a través de la membrana nuclear a través del complejo de poro nuclear.
Por el contrario, algunas proteínas contienen señales de exportación nuclear (NES), que son reconocidas y vinculadas por las exportaciones, que también facilitan la exportación de estas proteínas desde el núcleo a través del complejo de poro nuclear.
