¿Por qué el sistema o-tRNA / o-tRNA sintetasa se derivó del par TyrRS / tRNA de Methanococcus jannaschii?

Esto es una especulación, pero Methanococcus jannashcii fue una de las primeras especies de bacterias extremófilas con un genoma secuenciado, lo que sugiere que al menos era probablemente un organismo muy bien estudiado cuando la secuenciación era costosa . Los autores del primer papel tRNA ortólogo de M. jannashcii (desde 2001) buscaban un sistema tRNA / tRNA sintetasa que cumpliera con dos criterios: 1) el tRNA estaría cargado ineficazmente por las ARNt sintetasas de E. coli y 2) el ARNt ortólogo / El sistema tRNA sintetasa no se preocuparía de que el bucle anticodón (la parte que reconoce el ARNm) tuviera una secuencia alterada.

Al conocer la forma en que trabajan los científicos, probablemente eligieron a M. jannaschii porque fue la primera especie que encontraron (ayudada en parte por la secuencia del genoma) que cumplió con ambos criterios. El primer par de bases en el vástago aceptor del ARNt es diferente entre las especies, y las ARNt sintetasas de M. jannaschii no son correctas.

Fuente: Ampliación del código genético de Escherichia coli

Se debe agregar un tercer punto a los criterios. Las sintetasas ortogonales no deberían reconocer ARNt de E. coli; de lo contrario, los ARNt endógenos podrían aminoaclarse con aminoácidos no relacionados. Esto podría conducir a una disminución en la viabilidad ya que las proteínas incorporarían el aminoácido incorrecto.

Además, se ha demostrado la corrección de pruebas en el caso del ProRNA de tRNA sintetasa de M. jannaschii , que muestra la edición posterior y posterior a la transferencia con el aminoácido alanina. Un ejemplo donde se ha seleccionado editar es con Mycoplasma mobile PheRS.