¿Pueden las proteínas auto replicarse?

Las proteínas, por sí mismas, no tienen la capacidad de llevar a cabo la autorreplicación, pero pueden propagarla.

En las enfermedades priónicas (tembladera, enfermedad de las vacas locas, Creutzfeldt-Jakob, etc.), las proteínas priónicas dañinas y “rebeldes” pueden causar que las proteínas priónicas normales alteren su estructura de modo que coincidan con la estructura de las dañinas ( en otras palabras, los priones dañinos “convierten” a los priones normales en priones dañinos).

PrP denota “proteína priónica” normal y PrP ^ Sc denota “proteína priónica del prurigo lumbar” (el prurigo lumbar fue la primera enfermedad priónica descubierta). PrP ^ Sc hace que PrP se repliegue en PrP ^ Sc, lo que da como resultado la agregación de PrP ^ Sc. Si bien la estructura primaria (secuencia de aminoácidos) de ambas proteínas es exactamente la misma, los porcentajes de los elementos estructurales secundarios (hélices alfa y láminas plisadas beta) se alteran significativamente.

Aquí hay una ilustración simplificada del proceso de Page en Ursinus:

Pero la mayoría de las proteínas dentro y fuera de las células no se propagan por sí mismas.

No, no hay tal posibilidad. Esa es una de las razones por las que podemos estar seguros de que inicialmente había un mundo RNA. En el mundo del ARN, el ARN funcionó como la plataforma para producir catalizadores, es decir, ribozimas en lugar de enzimas, que se producen a partir de aminoácidos, es decir, son proteínas. Entonces, el mundo del ARN fue seguido por el mundo de las proteínas cuando se inventó la transformación. No veo ninguna razón para hablar de ningún mundo de ADN. El ADN probablemente se usó para el almacenamiento a largo plazo de información genética bastante temprano en el mundo del ARN. En mi opinión, fue el mundo de las proteínas el que hizo que los eucariotas completaran su configuración al agregar el citosol fuera del núcleo, que existía en el mundo del ARN. Luego vinieron organelos. Algunos de ellos viajaban, por ejemplo, para alcanzar los metabolitos necesarios, y algunos llegaron a ser tan autónomos que se convirtieron en bacterias cuando su huésped se extinguió. Otros operaron solo a nivel local. Se convirtieron en mitosomas, hidrogenosomas, mitocondrias y cloroplastos. La teoría de escape de Organelle describe esto aquí:

Conceptos erróneos en las teorías de la evolución

Las proteínas no se pueden formar a partir de otras proteínas. Las proteínas se traducen de ARNm con ARNt en el ribosoma. Sin embargo, ciertas proteínas pueden propagar su propia transcripción, actuando como factores de transcripción en un ciclo de retroalimentación positiva. Estos circuitos de retroalimentación positiva son muy importantes en el desarrollo.