No tengo acceso al artículo, pero las conformaciones funcionales intermedias se pueden capturar resolviendo la estructura en complejo con algún tipo de inhibidor del estado de transición, que físicamente atrapa la proteína en la conformación intermedia.
En los casos donde esto no es físicamente posible, es posible usar simulaciones de dinámica molecular para explorar la ruta de transición. Si tiene una estructura experimental “antes” y “después”, puede analizar la diferencia entre ellos, derivar coordenadas colectivas que probablemente sean importantes para la transición y luego utilizar la dinámica molecular para explorar el espacio de fase a lo largo de estas coordenadas.
Desafíos similares se han abordado con tales técnicas para comprender la dinámica de la función ribosómica.
