De acuerdo, seré sincero desde el principio. He echado un vistazo a un artículo de revisión único antes de intentar responder a esta pregunta, y la mayoría del contenido del que hablaré en esta respuesta se basa en un proyecto que hice hace aproximadamente un año.
Esencialmente, las bacterias intestinales (que es un término genérico para las miles o millones de especies bacterianas que florecen en nuestros intestinos) están involucradas en interacciones simbióticas con su huésped, principalmente en la digestión y el mantenimiento del tracto gastrointestinal. (Boulange et al., 2016).
Sin embargo, los mecanismos moleculares de tales interacciones no se conocen bien, en parte debido a la falta de técnica para extraer muestras de bacterias intestinales y en parte porque la gran variedad de especies dificulta atribuir una función / efecto particular a cualquier especie. Por el contrario, también es difícil determinar el papel exacto que desempeña una única cepa bacteriana en el estómago, en particular porque la flora microbiana se desarrolla a una edad muy temprana.
Recientemente, se ha desarrollado un nuevo tipo de animales específicamente para este tipo de estudios. Se llaman animales gnotobióticos (predominantemente ratones), y se extraen en el estadio fetal del útero y se alojan en un entorno libre de microbios. Como consecuencia, no tienen flora microbiana natural, lo que permite el estudio de los efectos de una sola cepa o una combinación de cepas por exposición a esa cepa (Williams, 2014). Sin embargo, este desarrollo es bastante reciente y no conozco ninguna caracterización masiva del microbioma intestinal, probablemente debido a la falta de métodos adecuados de detección de alto rendimiento. El campo todavía está en una etapa incipiente con mucho trabajo por hacer.
Dicha caracterización también sería de interés para los desarrolladores de fármacos, particularmente la elucidación de los efectos secundarios de posibles fármacos candidatos sobre bacterias específicas que ayudarían a reducir los efectos secundarios de los fármacos.
Referencias
¿Cuáles son los signos y síntomas de la vaginosis bacteriana?
¿Cuáles son buenos títulos de referencia para la fisiología bacteriana?
Impacto de la microbiota intestinal en la inflamación, la obesidad y la enfermedad metabólica
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc…