La metabolómica dirigida se centra en varios metabolitos (tal vez cientos en la actualidad) en los que está interesado, lo que significa que ya los conoce. Se usa para probar tu hipótesis.
Pero para la metabolómica no dirigida, se adquirirán todos los metabolitos, lo que significa que usted sabe que algunos metabolitos son diferentes en dos o más grupos de muestra, pero no saben exactamente qué son. Se usa para generar tu hipótesis.