La desnaturalización despliega la estructura secundaria y terciaria de la proteína, dejando intacta la estructura primaria (secuencia peptídica).
Esa estructura secundaria y terciaria puede ser muy compleja, lo que significa que no es la única configuración posible dada la estructura primaria, y puede incluso no ser la configuración más termodinámicamente favorable en condiciones posteriores a la desnaturalización. La proteína original podría haber requerido la ayuda de otras moléculas para entrar en la configuración original.
Si algo de esto es el caso, y si la función de esa proteína depende de la estructura, entonces cualquier proteína desnaturalizada que no se reconfigure en la misma configuración que antes de la desnaturalización no funcionará o no funcionará tan bien como la original proteína.
Cuanto mayor sea la proporción de proteínas incorrectamente replegadas, más actividad se perderá.
