¿Cuál es el mecanismo de la ADN primasa?

La ADN primasa es una enzima implicada en la replicación del ADN que crea un cebador de ARN. Este cebador de ARN se usa para replicar ADNss. La ADN polimerasa puede extender esta cadena existente al adherir un nucleótido de ADN al extremo del cebador de ARN y luego continuar pegando nucleótidos de ADN al extremo de la cadena de ADN de nueva formación.

Las ADN polimerasas agregan nucleótidos al extremo 3 ‘de la cadena de polinucleótidos. La polimerasa cataliza el ataque nucleofílico del extremo 3 ‘del grupo hidroxilo de la cadena de polinucleótidos en el grupo alfa fosfato de nucleósido trifosfato que se va a añadir. Para iniciar esta reacción, la ADN polimerasa requiere un cebador con un grupo 3 ‘hidroxilo libre ya emparejado con la plantilla. No pueden comenzar desde cero añadiendo nucleótidos a una plantilla de ADN monocatenario libre.

¿Cómo crea cebadores sin usar 3 ‘hydroxyl group?

La ARN polimerasa puede iniciar la síntesis de ARN denovo sin un cebador. La mayoría de las cadenas de ARN recién sintetizadas llevan una etiqueta altamente distintiva en el extremo 5 ‘. La primera base en ese extremo es pppG o pppA.

La presencia del resto trifosfato sugiere que la síntesis de ARN comienza en 5 ‘end. Los resultados de los experimentos de marcado con sustratos gamma 32 P confirmaron que las cadenas de ARN, como las cadenas de ADN, crecen en una dirección de 5 ‘a 3’.

Bueno, las ADN polimerasas son enzimas que necesitan un 3′-OH libre para su actividad, pero, por otro lado, la ARN polimerasa no, pueden sintetizar ARN sobre una plantilla de ADN sin ningún 3′-OH libre.

Los cebadores son necesarios por DNA Pol durante la replicación, ya que proporcionan la enzima con un grupo 3′-OH libre. La adición del cebador se lleva a cabo mediante la enzima Primase, que es una ARN polimerasa dependiente del ADN, y como en el caso del ARN Pol, no requiere ningún 3′-OH libre, la enzima primasa sintetiza cadenas cortas de ARN usando ADN como la plantilla, este ARN proporciona el 3′-OH libre al ADN Pol III, que luego sintetiza la cadena complementaria. Finalmente, los cebadores de ARN son eliminados por la enzima ADN Pol I. Después de la eliminación del cebador de ARN y el llenado del hueco con ADN, queda un corte en la cadena principal del ADN en forma de un enlace fosfodiéster roto. Estas mellas están selladas por ADN ligasas.

Las características de Primase son:

a. Producto monomérico del gen dnaG, la longitud del segmento de ARN sintetizador es de 1 a 60 nucleótidos, más precisamente 15-20 nt, dependiendo del tipo de especie.

segundo. Inicia la síntesis de cadena líder en el origen una vez por ciclo celular.

do. Facilita la iniciación repetitiva de fragmentos de Okazaki en la cadena rezagada.

re. Proporciona 3′-OH libre al DNA Pol.

mi. Se activa solo en la replicación del ADN pero no puede formar cadenas largas y, por lo tanto, no se usa en la transcripción.

F. Es insensible al inhibidor de ARN pol, Rifampicina.

Ref: – Principles Of Biochemistry, 5ª ed. David L. Nelson y Michael M. Cox.