¿Qué hay todavía para aprender sobre la replicación del ADN, la reparación del ADN, la transcripción y la traducción?

Cada uno de los temas enumerados por el interrogador son objeto de investigación abierta en cientos de laboratorios.

Nuestro conocimiento de cualquier tema en biología molecular está limitado por la tecnología contemporánea y las técnicas disponibles para investigar el tema.

El dogma central (ADN -> ARN -> proteína) era dogma en mi libro de texto de biología de la escuela secundaria. Pero, para el último año de la universidad, las tecnologías de generación de perfiles globales (por ejemplo, RNA-seq) sugirieron que la mayoría del genoma de los mamíferos podría transcribirse en RNA. La pregunta aquí para dilucidar es por qué una célula necesitaría o quisiera hacerlo. ¡Es un gasto increíble de recursos energéticos!

Tengo más experiencia en el área de la transcripción. Docena de documentos relacionados con la transcripción se publican cada semana. La mayoría son adiciones incrementales a nuestra comprensión general del tema. Pero, un buen número de publicaciones cada año ayuda a atar cabos sueltos o a un cambio de paradigma real.

Compartiré una de mis preguntas abiertas en el campo de la transcripción de genes.
¿Qué papel (si lo hay) juegan las interacciones de ADN de largo alcance en el alargamiento transcripcional eficiente? Sabemos que las interacciones potenciador-promotor están involucradas en el inicio de la transcripción. Pero un complejo de ARN polimerasa puede detenerse después de escupir ~ 100 bases de ARN y poner un amortiguador en la elongación.

Una nueva tecnología llamada CRISPR puede ayudarme a diseñar algunos experimentos complejos y elegantes para resolver esta cuestión de una manera que no era posible hace solo cinco años.

Trabajo en la reparación y replicación del ADN. Nuestra comprensión de estos procesos es muy básica. Todos los modelos que intentan explicarlos están destinados a ser incorrectos hasta cierto punto. Esto se debe a que no podemos ver las moléculas reales que realizan estos actos complicados ‘en vivo’. Solo podemos pensar en hipótesis y ver si nuestros datos de baja resolución las respaldan.

Mientras estas hipótesis se mantengan, construiremos a partir de ellas e idearán experimentos y modelos más complicados. En algún momento, nuestras teorías originales se desmoronan y son reemplazadas por modelos que se ajustan tanto a los datos antiguos como a los nuevos.

Estoy seguro de que si pudiéramos ver de algún modo los procesos bioquímicos reales en vivo, no podríamos distinguir la replicación de la traducción.