Si la biología de sistemas se define ampliamente como cualquier enfoque que intente comprender los fenómenos biológicos a través del análisis de conjuntos de datos grandes y complejos, vienen a la mente varias aplicaciones hipotéticas para el desarrollo de fármacos:
1. Fenotipos intermedios más precisos : los biomarcadores pueden rastrearse para evaluar las toxicidades / eficacia de los fármacos antes de las manifestaciones obvias. Es probable que los paneles de biomarcadores actualmente utilizados sean menos sensibles / precisos en comparación con lo que se puede lograr a través del análisis de perfiles moleculares globales.
2. Subpoblaciones objetivo : para cualquier medicamento dado es probable que haya subpoblaciones de individuos que obtendrían el mayor beneficio del tratamiento. Algunos biomarcadores han sido utilizados en este esfuerzo; de nuevo, sin embargo, el análisis de los perfiles moleculares globales probablemente mejoraría el rendimiento.
3. Objetivos farmacológicos más sofisticados : por lo general, los mecanismos farmacológicos implican una focalización simplista y directa de los procesos tardíos relacionados con la enfermedad / síntomas. Una mejor comprensión del sistema fisiológico a partir de un análisis global imparcial puede dar como resultado el descubrimiento de dianas farmacológicas más sofisticadas, tal vez mediante la elucidación de factores causales de la raíz o procesos endógenos contraproducentes que de otro modo serían difíciles de dilucidar.
Es importante recordar que el enfoque de biología de sistemas también tiene desventajas , como el requisito de diferentes técnicas analíticas, datos más costosos y la tendencia a sobreajustar.