En las enfermedades de agregación de proteínas (Alzheimer, Huntington, ALS y Parkinson), ¿el proceso de agregación de proteínas causa toxicidad o los agregados de proteínas son tóxicos?

Por lo que sé, el jurado todavía está por ahí en relación con este enigma. Mientras que los primeros estudios postularon que la agregación de TDP43 en el citoplasma de pacientes con ELA secuestra otras proteínas y forma…
¿Qué es ‘fase estacionaria’ en técnicas biofísicas y bioquímicas?

En las técnicas de cromatografía utilizadas para separar los componentes de una mezcla, utilizamos una configuración que consiste en fase estacionaria y móvil. Por ejemplo, en la cromatografía en columna preparamos un lecho usando una matriz sólida y…
¿Por qué las membranas biológicas son aptas para el equilibrio de la centrifugación de la densidad de sacarosa, mientras que las proteínas no lo son?

La centrifugación de densidad de sacarosa se utiliza en proteínas, de hecho se usa para separar proteínas entre sí en función de la densidad. A menudo se usa para purificar virus envueltos, y la envoltura de un virus…
¿Cuáles son las condiciones para tener FRET entre las moléculas de un tipo de material fluorescente?

De acuerdo con la teoría de FRET, primero, el espectro de absortión y la specturm de emisión deben tener superposición, lo que requiere un cambio de Stokes no demasiado grande para el tinte. En segundo lugar, debido a…
¿Cómo forma la caspasa 1 los poros en la membrana celular?

La pregunta de cómo la caspasa-1 inicia la piroptosis es interesante. Sin embargo, mi escaneo rápido de la literatura no trae revisiones generales recientes del tema. Encuentro una cantidad de trabajos de investigación individuales que estudian el problema…
¿Cuáles son las diferencias estructurales entre YFP, mCherry y GFP? ¿Es posible cambiar la estructura de una proteína de fluorescencia a otra para obtener el color de la otra?

Sorprendentemente, solo unos pocos cambios de aminoácidos separan un espectro completo de proteínas fluorescentes . La mayoría de las proteínas fluorescentes utilizadas en el laboratorio descienden de A. victoria (una medusa) GFP, que tiene una estructura que se…
Además de la cristalografía de rayos X, ¿cuáles son algunas formas de detectar la unión entre una molécula pequeña y una proteína, y formas de medir la afinidad de unión?

Para energéticos detallados en un pequeño conjunto de moléculas, la calorimetría isotérmica (da Kd, estequiometría, dH, dS). Para seleccionar un gran conjunto de moléculas, interferometría bioloayer (tecnología ForteBio :: BLI) (proporciona tasas aproximadas de encendido / apagado) También…
Química: ¿Cómo se diseñó / diseñó el tweezer molecular CLR01 específico de lisina?

El razonamiento detrás del diseño se puede encontrar en el documento original http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16218636 Fue diseñado para 1. el espacio entre los dos grupos fosfato en CLR01 coincide con la distancia entre el grupo amida y el nitrógeno con…
¿Por qué pueden aparecer múltiples picos en calor específico aunque la proteína realmente no tenga los correspondientes ‘estados de fase’?

Sin embargo, las proteínas realmente se someten a varias transiciones de pseudo-fase. Estas moléculas suelen estar repletas de regiones altamente organizadas, ya sean bolsas hidrofóbicas, redes de enlaces de hidrógeno en láminas \ beta altamente ordenadas, hélices en…
¿Cómo comienza la vida con los átomos y forma seres conscientes y funcionales?

Hay un primer paso, cómo la primera célula formada a partir de átomos y moléculas, que no conocemos. Lo cual no es muy sorprendente, porque ocurrió una sola vez, hace casi cuatro mil millones de años, en una…