¿Cuán computacionalmente costoso es predecir las interacciones de acoplamiento proteína-proteína, en relación con la predicción de la estructura de la proteína?

Proteínas plegables de los primeros principios: Meses y generalmente no tiene éxito excepto por las proteínas más pequeñas [1] Predicción de la estructura de la proteína usando estructuras previas en el PDB: 8 horas (ITASSER) Atraque de proteínas…
¿Cómo puedo calcular las frecuencias de aminoácidos / composiciones para proteínas en un archivo FASTA que contiene varias secuencias de proteínas?

Puede usar COPid: Calcular la composición de una herramienta web de proteínas. Secuencia (s) de aminoácidos dados Este programa calculará la composición de aminoácidos o dipéptidos o las propiedades químicas particulares de los aminoácidos. Y es compatible con…
¿Qué es XNA (ácido nucleico Xeno)?

Son polímeros de ácidos nucleicos como ADN o ARN, pero con alguna alteración química. Esta puede ser una estructura radicalmente diferente como la sustitución de la estructura azúcar-fosfato de la cadena principal por completo con un marco proteínico…
¿Cómo podemos predecir computacionalmente cómo un SNP afectará la función de una proteína?

Permítanme comenzar agregando un breve resumen de biología para contextualizar mi respuesta. Un SNP en alguna secuencia de ADN codificante podría dar como resultado una mutación sinónima o sinónima de aminoácidos. Recuerde, un solo aminoácido podría estar codificado…
¿Cuáles son las necesidades médicas no satisfechas que la bioinformática podría solucionar?

Puedes echar un vistazo al siguiente libro “Bioinformática para la ciencia biomédica y aplicaciones clínicas” – Por KH Liang Actualmente el objetivo del campo es mejorar 3 tipos: 1. Mejor diagnóstico 2. Proporcione una mejor predicción de eventos…
¿Qué tan bueno puede ser en este campo un estudiante de pregrado que estudie bioquímica y especialización en biología?

Si se pregunta hasta dónde puede llegar como biólogo o bioquímico con una licenciatura, entonces hay dos respuestas. 1. En la mayoría de las circunstancias, será limitado. Puede ser un técnico de laboratorio, de hecho ahora esto a…
Quiero ir a la escuela de posgrado en bioinformática. ¿Qué debo preparar para eso?

Si es posible, construya una base sólida en matemáticas, estadística, biología molecular, ciencias de la computación, bioquímica y campos relacionados. De estos, creo que las matemáticas y las estadísticas son las áreas realmente críticas. En particular, una comprensión…
¿Qué invenciones o descubrimientos no hubieran sido posibles sin una colaboración interdisciplinaria?

Si por colaboración interdisciplinaria en general quiere decir combinar el conocimiento de dos o más campos de estudio: no puedo pensar en ninguna invención importante que no sea el resultado de la colaboración interdisciplinaria. Si por colaboración interdisciplinaria…
¿Pueden los médicos especializarse en bioinformática de Cáncer?

Sí, por supuesto, y pueden hacer una investigación pionera también, si se considera lo siguiente – Me he dado cuenta de que un historial médico sólido lo aleja de pensar de manera abstracta en grandes cantidades de datos,…
¿Cuál es la diferencia entre Pfam y PROSITE?

Al alinear secuencias de proteínas, a menudo es evidente que ciertas regiones o aminoácidos específicos están más conservados que otros. Dichas regiones conservadas a menudo se conservan porque codifican una parte de la proteína que es funcionalmente importante.…