¿Cómo funciona la proteína verde fluorescente?

La respuesta está en un cuerpo de trabajo de Doug Prasher y William Ward y completada por el Premio Nobel Roger Tsien y un Roger Heim post-doctorado.

Tsien había estado trabajando en sondas fluorescentes para la señalización de Calcio y ya se había hecho un nombre con ese trabajo. En ese momento, el gen Aequorea victoria GFP fue clonado con éxito por Doug Prasher (es decir, el famoso desaire del Premio Nobel) y luego expresado por Martin Chalfie. Heim comenzó a trabajar en la identificación del cromóforo y, posteriormente, en la modificación del centro activo.

Como menciona Blue Scott, el cromóforo consta de 3 aminoácidos identificados por Cody y Prasher [1] como Ser65, Tyr 66 y Gly 67 formando una 4- (p-hidroxibencilideno) -imidazolidin-5-ona interna. Más tarde, Heim y Tsien muestran que se somete a una etapa de ciclación mediante un ataque nucleófilo del grupo amino Gly al carbonilo Ser, seguido de una etapa de autooxidación del residuo Tyr. [2] [3]

El resultado es un sistema pi-conjugado grande que, para un ojo entrenado, muestra un cromóforo que se excita a 395 nm. La desprotonación del Tyr Hydroxyl cambia la longitud de onda de excitación a 470 nm.

Conocer la estructura del cromóforo junto con conocer la estructura completa de GFP permitió a Heim y Tsien formular hipótesis inteligentes para manipular el núcleo de proteína para cambiar los espectros de excitación y emisión de GFP, así como para alterar la GFP para que funcione como un biosensor metálico. [4] [5] [6] [7]

Variantes GFP

[1] Estructura química del hexapéptido cromófo … [Bioquímica. 1993]
[2] Proteína Fluorescente Verde
[3] Mutaciones de longitud de onda y postransl … [Proc Natl Acad Sci US A. 1994]
[4] Fluorescencia verde mejorada.
[5] Estructura cristalina de la gripe verde Aequorea victoria … [Ciencia. 1996]
[6] La estructura molecular del fluorescente verde … [Nat Biotechnol. 1996]
[7] Química estructural de un fluorescente verde pr … [J Am Chem Soc. 2002]

La estructura de GFP se construye de la misma manera que cualquier proteína y, como tal, tiene múltiples niveles de estructura, así como múltiples métodos de interacción química. La base o estructura primaria de GFP es una cadena de 238 aminoácidos [16] que pesa aproximadamente 27,000 unidades de masa atómica (27 kDa) [12], con solo aproximadamente 4 de los aminoácidos produciendo directamente cualquier efecto de fluorescencia [8]. La estructura secundaria es una serie de hélices y láminas plisadas, causadas por enlaces de hidrógeno dentro de la cadena, mientras que la estructura terciaria es un barril hecho de 11 de las hojas, cubiertas con las hélices. En el centro de esto se encuentra el cromóforo, una cadena corta de aminoácidos alterados responsables de la emisión de luz. La estructura del cilindro mantiene el cromóforo alejado de los solventes, lo que hace que la GFP sea capaz de emitir fluorescencia bajo casi cualquier condición, pudiendo emitir fluorescencia casi hasta el punto en que la proteína se desnaturaliza por elementos como el calor y el pH [8].

-Desde Internet

http://www.chm.bris.ac.uk/motm/G