No soy químico farmacéutico, así que puedo ser un poco general en mi respuesta.
Según tengo entendido, el diseño racional de medicamentos (DRD) surgió como un sucesor revolucionario de la química combinatoria. El diseño del fármaco racional comienza con el conocimiento de los mecanismos biológicos que se utilizan para tratar una enfermedad e, idealmente, la estructura de las moléculas con las que debe interactuar un fármaco. Para una gran lectura, echa un vistazo a la molécula de mil millones de dólares (Amazon), que cuenta la historia de Vertex Pharmaceuticals, que fue un pionero en RDD.
Antes del DDR, la química combinatoria se usaba en gran medida para encontrar fármacos similares a los que funcionaban y ya se conocían (p. Ej., Si las secreciones de los hongos penicillium mataban bacterias, luego también probaban secreciones de otros hongos). La búsqueda consistió en encontrar variantes más efectivas, variantes menos tóxicas, etc. Con el advenimiento del modelado de moléculas avanzadas, se pensó que el DDR podía permitir el diseño de novo de fármacos basados en las estructuras de los objetivos farmacológicos.
Desearía tener la fuente para esto, pero recuerdo haber leído un papel elogiando el RDD, explicando que la lógica era defectuosa. Resulta que para que un medicamento interactúe eficazmente con un objetivo de enfermedad, no debe acoplarse con el objetivo tal como aparece en un cristal de rayos X normal, sino con un estado transitorio y temporal. Tal vez el modelado por computadora ha mejorado hasta el punto en que podemos postular estos estados de transición, pero la primera ronda de RDD se consideró un fracaso: las drogas no funcionarán
