Siempre me ha gustado escribir la ecuación de Kd de la siguiente manera:
Kd = ([Receptor] Free * [Ligand] / [Receptor-Ligand complex]).
Para aclarar, [Receptor] Gratis es la cantidad de receptor libre en solución, [Ligando] es la cantidad de ligando libre en solución, y [complejo receptor-ligando] es la cantidad de complejo en la solución. Como regla general, generalmente se sabe cuánto receptor está agregando al comienzo del experimento.
Entonces, para empezar, sabes lo siguiente:
[Receptor] Total = [Receptor] Gratis + [Complejo receptor-ligando]
Entonces, para una situación en la que te gustaría saturar, te gustaría algo así como aproximadamente 1% de receptor libre, ¿verdad? Si tienes ~ 1% de receptor libre, entonces eso significa que tienes las siguientes ecuaciones:
¿Puede una proteína localizada en el núcleo afectar la adhesión celular?
¿Puede la misma función biológica ser codificada por diferentes estructuras de proteínas?
[Complejo receptor-ligando] _ @ 1% receptor libre = 0.99 * [receptor] Total
[Receptor] Free_ @ 1% Receptor gratis = 0.01 * [Receptor] Total
Ahora sustituye las dos ecuaciones directamente arriba en la primera ecuación de esta publicación itinerante.
Kd = (0.01 * [Receptor] Total * [Ligando]) / (0.99 * [Receptor] Total)
Los términos de [Receptor] totales se cancelan tal como están en el numerador y el denominador. Esto te deja con:
Kd = (0.01 * [Ligando]) / (0.99) = 0.0101 * [Ligando]
Resolviendo para [Ligand]:
Kd / (0.0101) = [Ligando]
Esta es la cantidad de [ligando] que necesita para establecer una situación en la que el 99% de los receptores están unidos por el ligando.
Usando matemáticas similares, puede configurar diferentes condiciones en las que tenga un 5%, 10%, 50%, 79%, etc. vinculante (esto puede ser importante para los estudios de biofísica).
Si necesita una aclaración o una explicación adicional, por favor hágamelo saber.
