¿Las proteínas GPCR tienen bolsillos hidrófobos?

Postulado: la mayoría / muchos, sino todos los receptores olfativos de mamíferos son GPCR.

Observación: De estas OR de tipo GPCR, se han identificado OR que provocan una respuesta positiva, dependiente de la dosis, a odorantes hidroneutrales y ligeramente hidrófobos (octan-1-ol, nonanonas, acetofenona y similares).

Hipótesis: los aromatizantes se unen a las RUP como ligandos exógenos, por lo tanto, algunos de los bolsillos deben estar como mínimo hidroneutrados si se quiere que sean compatibles con la afinidad de los hidrocarburos.

Modelo de trabajo: mi propio trabajo de modelado teórico sugiere porciones hidrófobas del bolsillo para estabilizar el complejo ligando-receptor cuando el agonista de OR incluye restos de hidrocarburo. (Chem Senses. 2005 Nov; 30 (9): 781-92. Epub 2005 Oct 21), (Front Genet. 2012 3 de mayo; 3: 61. doi: 10.3389 / fgene.2012.00061)