Proline tiene una forma inusual para un aminoácido porque su grupo R se repliega sobre sí mismo para formar un anillo con el grupo amino de la columna vertebral.
Eso cambia el ángulo de unión de la cadena polipeptídica y causa un retorcimiento. Las hélices Alpha se mantienen unidas por enlaces de hidrógeno entre los grupos amino y carboxi de la cadena principal. El acodamiento causado por el anillo del grupo R impide que el grupo amino de la prolina participe en el enlace H habitual.
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