Hay varias maneras de descubrir la función de una proteína, pero ninguna es infalible. Primero, no todas las proteínas tienen una función. En segundo lugar, incluso si una proteína tiene una función, puede estar haciendo algo que todavía no comprendemos. En tercer lugar, muchas proteínas tienen más de una función, particularmente en virus (que necesitan mantener su genoma pequeño). Los enfoques que pueden revelar la función de una proteína incluyen:
- Identifique la mutación subyacente a una enfermedad hereditaria comparando el ADN en individuos afectados y normales de una familia extensa. Secuencia del segmento de ADN que está vinculado a la enfermedad. Busque en una base de datos central para encontrar secuencias de ADN similares que codifiquen proteínas con funciones conocidas. Verifica si tu proteína tiene una función similar.
- En un modelo animal (ratón), “knock-out” o de lo contrario apaga el gen para que la proteína activa ya no se haga. Identifica qué función (si la hay) se pierde en los knock-out frente a los animales normales.
- Purifique y caracterice la proteína desconocida con respecto al tamaño, composición y / o secuencia de aminoácidos, ubicación en la célula, características antigénicas, cofactores, etc. Busque proteínas previamente descritas que tengan características similares.
- Caracteriza la ubicación de la proteína en la célula y en diferentes órganos del cuerpo. Las proteínas que se encuentran en la mitocondria, por ejemplo, están típicamente involucradas en el transporte de electrones.
También puede obtener pistas de otros genes que se encuentran cerca del gen que codifica su proteína en el genoma del huésped. Las proteínas para una vía o proceso metabólico determinado a menudo se encuentran cerca unas de otras en el mismo cromosoma.
