¿Qué tan bueno es el dicroísmo circular para detectar una estructura secundaria inusual?

En general es excelente. A continuación se muestra un ejemplo de los diferentes espectros asociados con 5 diferentes tipos de estructura. La determinación de la abundancia relativa de cada uno de estos elementos se realiza ajustando un espectro medido a una combinación lineal de estos elementos. Debido a que un espectro típico está muy sobre determinado (hay más puntos medidos que espectros de referencia) la calidad del ajuste le indica si hay elementos que no está permitiendo en el ajuste. Si no se ajusta bien, ampliar el ajuste para incluir estos elementos estructurales más inusuales mejorará el ajuste. Desafortunadamente, todavía hay una pregunta abierta sobre si CD puede distinguir entre alfa y 3 (10) hélices.

310 hélices son muy difíciles de determinar por CD. Utilizando datos de sincrotrón de baja longitud de onda y grandes conjuntos de datos de referencia basados ​​en sincrotrón, solo se puede obtener un coeficiente de correlación de 0,385 para 310 hélices. Por el contrario, r = 0.960 para una hélice alfa. Los giros tampoco se pueden distinguir (Tipo 1 r = 0.463 Tipo II r = 0.125) La precisión para determinar el contenido de hélice de poliprolina es algo mejor- r = 0.641. Las hojas alfa son tan raras que ni siquiera son consideradas.

Fuente

BMC Bioinformática