El enlace carbono-flúor es muy estable. Muy. Por lo tanto, los medicamentos basados en flúor tienen vidas útiles comparativamente largas.
El enlace carbono-flúor también es extremadamente polar. Hay una fuerte carga negativa en el flúor que imita la carga de un grupo hidroxi. El cloro es similar a este respecto, pero más grande y más suave. Por lo tanto, los análogos de haluro de los compuestos hidroxi tienen topologías de superficie similares que afectan a las afinidades del receptor, pero pueden ser ligeramente más fuertes, más débiles, irreversibles o tener alguna otra mejora clínica significativa. Más importante aún para la industria farmacéutica, los análogos de flúor son potencialmente patentables como nuevas entidades químicas. Las empresas también pueden analizar los análogos de flúor de las drogas sustituidas con cloro.
El enlace carbono-flúor también es compatible con la formación de iones de carbono por retro-donación de electrones de flúor en una cáscara vacía del carbono adyacente. En esencia, se forma un doble enlace parcial carbono-flúor. Esto es un efecto suficiente para hacer que el difluorocarbeno sea momentáneamente estable y para que sea el único carbeno más estable en un estado fundamental singlete (no radical) que el estado triplete (di-radical). Pero no sé si este fenómeno tiene alguna relevancia para el diseño del fármaco o el efecto de interacción del receptor.
Espero que esto ayude.