¡Gracias por aclarar a Robin!
Dentro de los humanos (y otros eucariotas), los orgánulos de las mitocondrias tienen su propio código genético autónomo, y en comparación con el ADN nuclear (autosómico, cromosomas X, Y) usa codones ligeramente diferentes. En ADN nuclear, UGA, UAG y UAA son codones de parada, pero en la mitocondria, UGA codifica triptófano y AUA isoleucina en nuclear y metionina en mitocondrial.
Entre las especies, esto puede variar mucho, especialmente entre los reinos de la vida. En general, los cambios son solo unas pocas diferencias de aminoácidos y, a menudo, dan lugar a cambios entre los aminoácidos con propiedades similares. Sin embargo, esto puede dar como resultado un “sesgo de codón” o una preferencia por un codón específico. A menudo, esto está influenciado por la disponibilidad de ciertos aminoácidos dentro de los organismos. Las vías metabólicas complejas codifican aminoácidos y la efectividad e incluso la presencia pueden variar entre individuos, por lo que evolutivamente si un organismo tiene mucha leucina por ejemplo porque puede hacerlo fácilmente, pero hay muy poca isoleucina disponible, la selección puede favorecer los codones de leucina sobre la isoleucina aunque las propiedades de los aminoácidos son similares.
“¿Presumiblemente la transferencia horizontal de genes no funcionaría entre organismos con diferentes códigos genéticos?” La transferencia genética horizontal bien implica una sección de código genético intercambiada entre organismos, y el sesgo de codones no necesariamente afectaría este proceso. Lo que afectaría (y debe tenerse en cuenta al modificar genéticamente el ADN de un organismo a otro) es la existencia de diferentes sesgos de codones y su efecto sobre la capacidad de producir la proteína con la misma eficacia. Utilizando nuestro ejemplo anterior, si el ADN de una criatura contenía muchos codones de isoleucina y se transfirió a nuestro organismo con muy poca isoleucina disponible, se haría muy poca proteína por “falta de material”.