Hmm, pregunta interesante. Obviamente, usted ya sabe que, por mucho, la mayoría de los antibióticos clínicamente relevantes (y otros metabolitos secundarios utilizados como medicamentos) son producidos por los actinos; muchos también son producidos por hongos, pero usted está específicamente interesado en las bacterias, supongo.
La mayoría de las especies producirán un tipo de antimicrobiano u otro, supongo, debe dar algún tipo de ventaja selectiva en entornos naturales. E. coli produce colicinas, Bacillus produce subtilisina (y posiblemente algunos otros, no lo recuerdo en este momento), las especies de Pseudomonas producen fenazinas y pioveridinas (y, nuevamente, creo que otros, no lo recuerdo en este momento). La mayoría de las bacterias, si no todas, producirán uno o más sideróforos (como la pioveridina) para eliminar el hierro del medio ambiente; a menudo se producen utilizando vías similares a la producción de antibióticos y, de manera similar, dan a las bacterias productoras una ventaja competitiva (en términos de crecimiento, no en términos de matar bacterias vecinas).
Muchos proyectos se han centrado en tomar muestras del suelo, el medio marino u otros entornos, y detectar antimicrobianos / metabolitos secundarios, y siempre, o casi siempre, encontrar algo (es encontrar algo novedoso que es más difícil, por supuesto). Ver, por ejemplo:
La minería del genoma revela el potencial bioactivo desbloqueado de las bacterias Gram negativas marinas.
El volcán submarino Kolumbo de la isla de Santorini es un grupo grande de cepas bacterianas con actividad antimicrobiana.
Investigación de bacterias con genes de policétido sintasa y actividad antimicrobiana aislada de esponjas del Mar del Sur de China.
Actividad antibacteriana de bacterias cultivables marinas recolectadas a partir de un muestreo global de aguas superficiales oceánicas e hisopos superficiales de organismos marinos.
¿Cómo influye la bacteria intestinal en el cerebro?
¿Las bacterias pueden causar una infección en la piel intacta, como los virus?
¿Cómo o dónde hacen los procariotas sus fospolípidos?
Entonces, en resumen, generalmente encontrarás un metabolismo secundario en todas partes. Algunas, aunque no todas, de estas rutas metabólicas se expresan en condiciones de laboratorio y conducen a la producción de compuestos útiles (para nosotros). (Otros son silenciosos o crípticos, bajo las condiciones de crecimiento utilizadas en el laboratorio). Muchas de estas vías conducen a la producción de moléculas pequeñas para las cuales no conocemos la función, o que no son útiles para nosotros, pero que son presumiblemente importante para el organismo productor de alguna manera.
