¿Deben conectarse los ribosomas con el retículo endoplásmico rugoso?

No. También hay un grupo de ribosomas en el citosol. Estos dos grupos de ribosomas difieren en su rol. Los ribosomas ER asociados producen proteínas que están destinadas a la membrana plasmática (o cualquier membrana) o que se secretan, mientras que los ribosomas citosólicos producen todas las demás proteínas.

No. Los ribosomas pueden ser gratuitos, y ese es el caso de las bacterias y otros organismos que no tienen ER.