¿Qué hace que una proteína pueda ser ‘cebo’ o ‘presa’ en la detección de dos híbridos de levadura?

En general, el cebo es la proteína que ya conoce. Entonces ya lo sabes, su secuencia y te gustaría saber si interactúa con otras proteínas. Por lo tanto, la presa puede considerarse cualquier proteína que idealmente interactuará con su proteína ya conocida. Entonces, cada proteína puede ser un cebo y también una presa. (al menos en teoría, no sé si existen algunas limitaciones con respecto al tipo de proteína involucrada).

El factor de transcripción puede interferir con su interacción cebo-presa. Lo que puede preguntarse es si esta interferencia ocurre fisiológicamente o no (tal vez la presa o el cebo que expresa ectópicamente en la levadura, tiene algún interactor fuera de tema). Tal vez la presa y el cebo pueden interactuar solo bajo ciertas condiciones, por ejemplo bajo condiciones de estrés. Entonces, cuando no hay estrés, las presas y el cebo no necesitan interactuar, por lo tanto, un factor de transcripción o un ARN no codificante (tal vez) evitará que se adhieran a él o simplemente la presa o la forma del cebo no pueden encajar . Entonces puede intentar probar diferentes condiciones. Puede hacer una hipótesis sobre lo que puede ser esta condición, de acuerdo con su cebo. Por ejemplo, si su cebo es una chaperonina, entonces puede interactuar con su presa cuando ocurre un choque de calor. Tal vez es un canal para la importación de un tipo de azúcar (por lo que funciona en condiciones de inanición) y cosas así.

Pero en la mayoría de los casos, si su cebo y su presa interactúan normalmente en una celda viva (en condiciones fisiológicas o no), a menos que haya problemas tecnicos, usted verá una interacción.