Hay algunas maneras en que el pH puede afectar la unión de un ligando / fármaco a un receptor. Hay dos categorías principales, al afectar al ligando y al afectar al receptor.
Afectar al ligando
Esta es la relativamente más simple de las dos categorías. Los cargos sobre el ligando pueden verse afectados, dependiendo de la acidez y la basicidad de los grupos funcionales en el ligando. Esto, a su vez, afectará las interacciones electrostáticas entre el ligando y el receptor y, por lo tanto, mejorará o debilitará su unión al receptor.
Afectando el receptor
Hay dos formas en que el pH puede afectar el receptor al cambiar las cargas en el receptor. Primero, en el sitio de unión del receptor, las cargas pueden potenciar o debilitar su unión del ligando, similar a lo que se ha discutido anteriormente. En segundo lugar, la conformación completa del receptor puede cambiar como resultado de cambios en hidrofilicidad e hidrofobicidad. La forma del bolsillo / sitio de unión puede modificarse, y esto a su vez puede potenciar o debilitar su unión del ligando.
Nota: he supuesto que el ligando es relativamente pequeño para que su conformación no importe. En realidad, el ligando puede ser una proteína grande, de modo que las cargas electrostáticas modificadas también pueden cambiar su conformación.