Excelente pregunta! Varias razones para:
Geles de acrilamida proteicos verticales:
- Más fácil para lanzar geles de resolución y apilamiento (o capas múltiples)
- Evita la oxidación de la acrilamida, que interfiere con la polimerización
- Geles delgados: útiles para concentrar proteínas, teñir y transferir a una membrana. También evita que el gel se caliente demasiado.
- Más fácil cargar muestras en pozos verticales delgados
- Evita la mezcla de los amortiguadores de electrodo negativo y positivo, por lo tanto, mantener un gradiente de potencial a través del gel
Geles de agarosa ADN horizontales:
- Fácil de moldear, cargar muestras y ejecutar
- Se necesita una gran cantidad de tampón de tanque circulante para enfriar el gel (ya que la agarosa tiene una temperatura de fusión baja).
- Puede hacer pozos grandes, útiles para purificar grandes cantidades de ADN.