¿Cuál es la razón para realizar la electroforesis en gel de proteínas manteniendo el gel en posición vertical mientras se realiza la electroforesis en gel de ADN manteniendo el gel en posición horizontal?

Excelente pregunta! Varias razones para:

Geles de acrilamida proteicos verticales:

  • Más fácil para lanzar geles de resolución y apilamiento (o capas múltiples)
  • Evita la oxidación de la acrilamida, que interfiere con la polimerización
  • Geles delgados: útiles para concentrar proteínas, teñir y transferir a una membrana. También evita que el gel se caliente demasiado.
  • Más fácil cargar muestras en pozos verticales delgados
  • Evita la mezcla de los amortiguadores de electrodo negativo y positivo, por lo tanto, mantener un gradiente de potencial a través del gel

Geles de agarosa ADN horizontales:

  • Fácil de moldear, cargar muestras y ejecutar
  • Se necesita una gran cantidad de tampón de tanque circulante para enfriar el gel (ya que la agarosa tiene una temperatura de fusión baja).
  • Puede hacer pozos grandes, útiles para purificar grandes cantidades de ADN.

Es posible usar geles de placas verticales de agarosa, y lo he hecho yo mismo, aunque probablemente estoy mostrando mi edad. La electroforesis en gel de losa vertical en realidad precedió a los geles horizontales para el análisis de ácidos nucleicos, pero tomó algunos años antes de que descubriéramos que era mucho más fácil moldear geles de agarosa horizontales que los verticales.