Las imágenes por resonancia magnética son mejores para observar los tejidos blandos. Los huesos son casi invisibles en las imágenes por resonancia magnética.
Las tomografías computarizadas son mejores para observar los huesos. Muestran algunos detalles de los tejidos blandos, pero no tanto como una resonancia magnética.
Las tomografías computarizadas son más rápidas, algunas veces solo toman unos segundos para completarse, y generalmente son más baratas que las imágenes por resonancia magnética, pero requieren el uso de radiación ionizante, lo que puede aumentar el riesgo de cáncer más adelante en la vida. En general, cuanto más rápida sea la máquina de TC, mayor será la tasa de dosis de radiación.
Las imágenes por resonancia magnética no producen ninguna radiación ionizante, pero el paciente puede necesitar permanecer inmóvil entre 45 y 90 minutos, dependiendo de la parte del cuerpo que se va a tomar una imagen.
La mayoría de las máquinas de MRI no pueden obtener imágenes de pacientes con partes metálicas implantadas, como marcapasos o clips, placas o tornillos quirúrgicos que no sean resistentes a MRI. Las tomografías computarizadas no se preocupan por las piezas de metal, aunque los elementos metálicos implantados pueden producir artefactos que ocultan detalles importantes.
Cada modalidad de imagen tiene ventajas, dependiendo de lo que desee examinar.