¿Qué es un intercambio de etiquetas en el etiquetado de proteínas?

El marcado de proteínas es la conjugación química o incorporación metabólica de moléculas indicadoras (por ejemplo, isótopos). Se necesitan experimentos de intercambio de etiquetas para eliminar los sesgos de observación exhibidos por diferentes etiquetas. Por ejemplo, considere dos condiciones experimentales biológicas y dos etiquetas. Cada condición experimental biológica se asignará aleatoriamente a una etiqueta, y luego en otro experimento estas etiquetas se intercambiarán (es decir, se intercambiarán). Los sesgos se eliminarán al considerar las diferencias relativas observadas entre las condiciones experimentales biológicas en ambos experimentos.

Hay otro fenómeno además del único Vandon Duong que podría llamarse un intercambio de etiquetas, aunque lo llamaría “intercambio de etiquetas”. Ocurre si el átomo etiquetado puede migrar a una molécula diferente a través de una reacción distinta a la que le interesa, si el etiquetado resultante podría interferir con lo que le interesa ver. Por ejemplo, supongamos que mezcló timidina tritiada en un medio de cultivo con la esperanza de etiquetar específicamente ADN recientemente biosintetizado. Es una apuesta bastante buena, especialmente si la cultura crece rápidamente. Sin embargo, hasta cierto punto, la timidina está sujeta a todas las demás reacciones a las que está sujeto el catabolismo de la timidina, y las porciones marcadas de algunas de esas moléculas podrían aparecer, por ejemplo, en las proteínas de la cromatina. Tal intercambio de etiquetas puede difuminar el resultado que está buscando.