Antes de la década de 1960, cuando no existían técnicas como la RMN o la radiografía, ¿cuál era el método para predecir la estructura 2-D o 3_D de las proteínas?

La química no es realmente mi fortaleza, pero lo probaré …

A finales de los años 50, se desarrolló un método para identificar la secuencia de aminoácidos de la insulina (recogí un Nobel, creo), pero esa es solo la estructura primaria.

No respondió ninguna pregunta sobre el plegamiento de proteínas. Una hipótesis sobre la conformación nativa de una cadena de proteínas no existió hasta aproximadamente principios de los años 60.

Ahora bien, esta hipótesis (Anfinsens Dogma) solo funcionó para las proteínas globulares, como las enzimas, algunas de las cuales pueden volver a plegarse después de la desnaturalización (las proteínas fibrosas, que normalmente se usan para las estructuras, no pueden). También se basó en la secuencia amino sola, que podría producir innumerables configuraciones. Las reacciones hidrofílicas / hidrofóbicas, la salinidad y otros factores aún no se habían explorado.

Pero la forma de un sitio activo de enzimas podría inferirse al descubrir un compuesto que lo inhiba.

Pero una de las herramientas más importantes (en mi opinión) era una especie de crowdsourcing: recuerdo un proyecto de software llamado Rosetta; un rompecabezas para hacer pliegues de proteínas, estilo Tetris. La gente lo descargó, jugó el juego (o lo dejó funcionar), y los mejores fueron examinados para las conformaciones nativas. Intentaron ejecutar los algoritmos en supercomputadoras, pero se sobrecalentaron.

En los primeros días, había más preocupación sobre la determinación de los componentes del sitio activo, la estructura y los estudios de correlación de función para determinar las técnicas de modificación química más utilizadas. Con el tiempo de fluorescencia se usaron la transferencia de energía y la reticulación para determinar las distancias intramoleculares.