¿Es tan contradictorio como creo que es tomar mi melatonina con café?

De ningún modo.

¡Oh espera! ¡Olvidaste un detalle! ¿Estás tomando melatonina para conciliar el sueño? Entonces sí, es contrario a la intuición. O más bien, es contraproducente.

Tomo melatonina para tratar de regular mi ritmo circadiano. Por qué el café no es directamente contraproducente en este caso debe ser claro.

Necesita especificar estos detalles, tiene mucha relación con la utilidad de posibles respuestas.

A menos que sea descafeinado, sí. ¿Por qué estás haciendo eso?