Las proteasas rompen el enlace peptídico que mantiene unidos los aminoácidos en una proteína. Se clasifican principalmente en dos tipos:
- Exo-proteasas que rompen los aminoácidos terminales, dejando un aminoácido y un péptido como productos. por ejemplo, MHFDEER se rompe en M y HFDEER mediante una proteasa amino terminal.
- Endo proteasas que se rompen entre la cadena polipeptídica en residuos específicos. por ejemplo, MHFDEER se rompe en MH y FDEER mediante una endoproteasa.